比利时按照语言分为弗拉芒语（荷兰语）区、法语区和德语区。高等教育分别由各区教育部负责，高等教育机构主要分布在弗拉芒语区和法语区。 弗拉芒语区有7所大学，22所高等专科学校。法语区有9所大学，30所高等专科学校，12所艺术院校，4所音乐戏剧学院及4所建筑学院。
比利时从2004-2005学年起，实施构建欧洲高等教育体系的波罗尼亚改革，大学学制分为两个阶段，第一阶段为学士课程，至少三年，180个学分；第二阶段为硕士课程，一至两年，至少60至120个学分，并需要撰写论文。